自动清洗工艺对玻璃器件、实验设备和操作人员提供了好的保护。
制药洗瓶机的自动化处理更容易标准化、进行验证和保存记录。并且洗瓶机可以批量处理玻璃器皿,极大的提高了清洗的效率,降低操作人员的劳动强度。使得科研工作者有更多宝贵的时间处理其它重要工作。
由于洗瓶机一次可以将大批量相同/相近规格的玻璃器皿清洗干净,例如:可以一次清洗300个或更多的培养皿,1000只以上的试管,或者几十个容量瓶。
考虑到实验室的玻璃器皿有不同的结构、尺寸和容量,如果能够将玻璃器皿进行适当的分类,选配合适的装置支架,这样才能够发挥洗瓶机的强大的清洗能力。
有些形状复杂或者细小的器皿或零部件,使用其它的清洗方式,例如超声波,可能效率更高、效果更好。如果残留物中含有遇热会凝固的蛋白质,使用制药洗瓶机时需要特别的小心,需要在室温下先将蛋白质清洗干净,然后再加热清洗。
但仍然存在蛋白质凝固后粘附在设备内表面或器件表面的可能性,清理起来非常麻烦。类似的情况还有非常粘附的聚合物等。在这种情况下,适当的预处理可能是必须的。
另外,受制于清洗设备和水基清洗剂适用范围的限制,某些水基清洗剂无法湿润渗透或溶解的难溶性残留物,例如某些试验需要用到强氧化性酸高温消解样品时残留的复杂的难溶物,无法通过制药洗瓶机清洗干净。